มาโครฟาจเป็นเซลล์สำคัญของการตอบสนองภูมิคุ้มกันโดยธรรมชาติของเรา โดยการเติมเนื้อเยื่อเกือบทั้งหมดในร่างกายของเรา เซลล์เหล่านี้มีบทบาทสำคัญในการรักษาอวัยวะของเราให้อยู่ในสภาพที่แข็งแรง เนื่องจากเซลล์เหล่านี้จะกำจัดเซลล์ที่กำลังจะตายหรือกำจัดจุลินทรีย์ที่บุกรุกเนื้อเยื่ออย่างต่อเนื่อง เนื่องจากเซลล์ที่เชี่ยวชาญในการกินและการกิน
มาโครฟาจจึงได้รับการดัดแปลงอย่างดีเป็นพิเศษเพื่อดูดซับ ย่อย และทำลายสิ่งแปลกปลอม จุลินทรีย์และแบคทีเรียบางชนิด เช่น ซัลโมเนลลาได้พัฒนากลยุทธ์ในการป้องกันตนเองจากความพยายามในการย่อยอาหารของมาโครฟาจ ทำให้เกิดการติดเชื้อไทฟอยด์อย่างรุนแรงและการอักเสบ การแทรกสอดระหว่างอวัยวะภายในระหว่าง phago-lysosomes และ mitochondria ยับยั้งการเติบโตของแบคทีเรียดังกล่าวภายในมาโครฟาจได้อย่างไร สัญญาณจากออร์แกเนลล์เซลล์ย่อยอาหาร ภายในของมาโครฟาจ เช่นเดียวกับเซลล์อื่นๆ ส่วนใหญ่ แบ่งออกเป็นส่วนต่างๆ ที่แตกต่างกันออกไป ออร์แกเนลล์ที่เรียกว่า ออร์แกเนลล์ เหล่านี้มีหน้าที่เฉพาะภายในเซลล์ เปรียบได้กับระบบอวัยวะของมนุษย์ ซึ่งทำหน้าที่ตามบทบาทเฉพาะในร่างกายของเรา ในฐานะเซลล์เก็บขยะระดับมืออาชีพ มาโครฟาจมีออร์แกเนลล์ย่อยอาหารที่โดดเด่นมาก นั่นคือ ฟาโก-ไลโซโซม ซึ่งจุลินทรีย์ที่ถูกดูดกลืนมักจะถูกย่อยสลายเป็นชิ้นๆและหยุดทำงาน